MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Enterococcus faecalis D32 plasmid EFD32pB

Total Repeats: 318

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018223	ATT	2	6	1533	1538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018223	TGT	2	6	1574	1579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018223	T	6	6	1605	1610	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018223	A	8	8	4249	4256	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018223	A	8	8	4268	4275	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018223	T	6	6	4311	4316	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018223	AGT	2	6	4325	4330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018223	T	6	6	4330	4335	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018223	A	7	7	4373	4379	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018223	TAT	2	6	4426	4431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018223	A	7	7	4461	4467	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018223	ATT	2	6	4476	4481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018223	T	7	7	4500	4506	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018223	ATT	2	6	4510	4515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018223	TAAA	2	8	4536	4543	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018223	TGTT	2	8	4549	4556	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018223	CAA	2	6	4596	4601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_018223	A	8	8	4600	4607	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018223	CTGG	2	8	4618	4625	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_018223	TCA	2	6	4647	4652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_018223	TTG	2	6	4685	4690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018223	ACA	2	6	4702	4707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_018223	TAT	2	6	4713	4718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018223	T	6	6	4746	4751	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018223	TCT	2	6	4777	4782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_018223	T	7	7	4887	4893	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018223	ATG	3	9	4912	4920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018223	AGG	2	6	4924	4929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018223	A	6	6	5284	5289	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018223	TCT	2	6	5297	5302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_018223	TGTGA	2	10	5344	5353	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018223	AAG	2	6	5374	5379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018223	ACA	2	6	5465	5470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_018223	ATG	2	6	5526	5531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018223	AGC	2	6	5609	5614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_018223	CTT	2	6	5639	5644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_018223	A	6	6	5650	5655	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018223	AGGT	2	8	5695	5702	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018223	TG	3	6	5703	5708	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018223	TAA	2	6	5731	5736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018223	A	6	6	5735	5740	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018223	ACATT	2	10	5745	5754	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_018223	AATT	2	8	5804	5811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018223	AAG	2	6	5825	5830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018223	TAA	2	6	5952	5957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018223	A	6	6	5956	5961	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018223	A	6	6	5977	5982	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018223	AAATA	2	10	5988	5997	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018223	TAGT	2	8	6002	6009	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018223	GTT	2	6	6016	6021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018223	ATT	2	6	6046	6051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018223	A	7	7	6076	6082	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018223	A	8	8	6130	6137	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018223	GGA	2	6	6691	6696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018223	AG	3	6	7805	7810	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018223	GTG	2	6	7881	7886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018223	A	7	7	7933	7939	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018223	A	6	6	7986	7991	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018223	TCCT	2	8	7992	7999	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_018223	A	6	6	8038	8043	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018223	TTA	2	6	8055	8060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018223	AGG	2	6	8061	8066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018223	AAAG	2	8	8917	8924	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018223	A	6	6	8960	8965	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018223	TTA	2	6	9000	9005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018223	TA	3	6	9017	9022	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018223	GT	3	6	9040	9045	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018223	T	7	7	9054	9060	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018223	T	6	6	9068	9073	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018223	ATT	2	6	9078	9083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018223	TGT	2	6	9089	9094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018223	TAAG	2	8	9118	9125	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018223	AAGA	2	8	9175	9182	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018223	TA	3	6	9187	9192	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018223	AAAT	2	8	9201	9208	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018223	ATT	2	6	9214	9219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018223	GTT	2	6	9674	9679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018223	T	6	6	9707	9712	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018223	A	8	8	9781	9788	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018223	AAG	2	6	9817	9822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018223	GT	3	6	9840	9845	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018223	GTT	2	6	9887	9892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018223	A	8	8	9945	9952	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018223	GAA	2	6	10000	10005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018223	GGA	2	6	10355	10360	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018223	CTTAG	2	10	11740	11749	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
87	NC_018223	AAT	2	6	11780	11785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018223	TA	4	8	11806	11813	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018223	ATA	2	6	11818	11823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018223	TAA	3	9	11849	11857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018223	AG	3	6	11880	11885	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018223	TAT	2	6	12343	12348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018223	T	10	10	12646	12655	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018223	A	6	6	12676	12681	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018223	A	6	6	12684	12689	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018223	A	7	7	12695	12701	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018223	AAAT	2	8	12750	12757	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018223	A	6	6	12760	12765	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018223	AAG	2	6	12768	12773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018223	TA	3	6	13632	13637	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018223	AAG	2	6	13646	13651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018223	CAA	2	6	13652	13657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_018223	TTG	2	6	13674	13679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018223	CTT	2	6	13680	13685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_018223	T	7	7	13684	13690	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018223	GCAA	2	8	13736	13743	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_018223	ATT	2	6	13746	13751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018223	AGG	2	6	13754	13759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018223	GTT	2	6	17813	17818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018223	AAT	2	6	17841	17846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018223	GGAA	2	8	17912	17919	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018223	AGGAGA	2	12	17926	17937	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018223	TAA	2	6	17967	17972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018223	A	6	6	17974	17979	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018223	A	6	6	18072	18077	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018223	T	7	7	18108	18114	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018223	AAT	2	6	18172	18177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018223	CTA	2	6	18724	18729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_018223	GAG	2	6	18754	18759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018223	TTG	2	6	19394	19399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018223	T	6	6	19457	19462	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018223	TAA	2	6	19490	19495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018223	AGG	2	6	19509	19514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018223	TGTA	2	8	19935	19942	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018223	AG	3	6	19961	19966	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018223	GAA	2	6	20030	20035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018223	TAC	2	6	20037	20042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_018223	T	6	6	20165	20170	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018223	TA	3	6	20195	20200	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018223	AAAT	2	8	20205	20212	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018223	A	6	6	20236	20241	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018223	A	6	6	20256	20261	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018223	TA	3	6	20279	20284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018223	A	7	7	20300	20306	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018223	AAAT	2	8	20309	20316	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018223	GGA	2	6	20317	20322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018223	GA	3	6	21812	21817	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018223	TA	3	6	21832	21837	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018223	GGTT	2	8	21839	21846	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018223	T	6	6	21848	21853	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018223	AAG	2	6	21854	21859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018223	AT	3	6	21860	21865	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018223	AGG	2	6	21873	21878	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018223	T	7	7	22964	22970	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018223	ATG	2	6	23002	23007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018223	GAA	2	6	23008	23013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018223	ATG	2	6	23031	23036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018223	A	7	7	23039	23045	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018223	A	7	7	23059	23065	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_018223	AAAAG	2	10	23884	23893	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
151	NC_018223	AAG	2	6	23932	23937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_018223	A	7	7	23956	23962	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_018223	T	7	7	24016	24022	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_018223	TTAT	2	8	24033	24040	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_018223	T	7	7	24332	24338	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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164	NC_018223	T	7	7	24466	24472	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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301	NC_018223	TTA	2	6	61617	61622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
302	NC_018223	ATT	2	6	61689	61694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
303	NC_018223	TAA	2	6	61725	61730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
304	NC_018223	T	6	6	61735	61740	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
305	NC_018223	ATTTTT	2	12	61785	61796	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
306	NC_018223	AT	3	6	61800	61805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
307	NC_018223	T	7	7	61844	61850	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
308	NC_018223	A	8	8	61855	61862	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
309	NC_018223	TTC	3	9	61931	61939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
310	NC_018223	GA	3	6	61946	61951	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
311	NC_018223	ACT	2	6	61956	61961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
312	NC_018223	AG	3	6	61995	62000	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
313	NC_018223	CT	3	6	62007	62012	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
314	NC_018223	GAC	2	6	62036	62041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
315	NC_018223	AT	3	6	62044	62049	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
316	NC_018223	A	6	6	62065	62070	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
317	NC_018223	T	7	7	62132	62138	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
318	NC_018223	GGT	2	6	62151	62156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.